18 июня футболист был доставлен в больницу после автокатастрофы с тяжелой черепно-мозговой травмой. Обстоятельства несчастного случая до сих пор остаются невыясненными. Водитель мотоцикла, пассажиром которого был пострадавший, скрылся с места происшествия. Следственная бригада, работавшая на месте происшествия, установила, что столкновения не было.
Гильмуллин находился в коме, хотя в последние дни его состояние стабилизировалось, а все внутренние органы работали самостоятельно, кроме дыхательных (Гильмуллин был подключен к аппарату искусственной вентиляции легких).
В чемпионате России - 2006/07 Гильмуллин, которому 17 июня исполнилось 22 года, принял участие в 11 матчах и забил один гол. После 13 туров «Рубин» занимает 13-е место в турнирной таблице.